ร่างกายมนุษย์รู้จักโมเลกุลโปรตีนที่แตกต่างกันประมาณ 50,000 ชนิด ซึ่งหน้าที่ของโปรตีนจะถูกกำหนดโดยลำดับกรดอะมิโนของพวกมัน ด้วยปฏิกิริยาทั้งชุด ร่างกายของเราสามารถสังเคราะห์โปรตีนที่ต้องการได้เองโดยเริ่มจากกรดอะมิโนเดี่ยวที่มีอยู่ในอาหาร เนื่องจากโปรตีนมีขนาดใหญ่เกินกว่าที่จะถูกดูดซึมและลำเลียงเข้าสู่กระแสเลือด เอ็นไซม์บางชนิดที่อยู่ในรูของระบบทางเดินอาหารจึงเข้าไปแทรกแซงการย่อยอาหารของพวกมันโดยแยกย่อยออกเป็นกรดอะมิโนแต่ละชนิด
โปรตีนส่วนใหญ่ลดลงอย่างสมบูรณ์ในกรดอะมิโนเดี่ยว การย่อยของโมเลกุลขนาดใหญ่เหล่านี้เริ่มต้นในกระเพาะอาหารซึ่งการทำงานร่วมกันของเปปซิโนเจนและกรดไฮโดรคลอริกนำไปสู่การก่อตัวของโอลิโกเปปไทด์ (สายสั้นของกรดอะมิโนที่เกิดขึ้นน้อยกว่าสิบหน่วย)
กรดไฮโดรคลอริกนอกจากจะเปลี่ยนเปปซิโนเจนเป็นเปปซินแล้ว ยังทำลายปริมาณแบคทีเรียส่วนใหญ่ ช่วยการดูดซึมธาตุเหล็กและการสังเคราะห์น้ำในลำไส้ น้ำดี ไบคาร์บอเนตและเอนไซม์ตับอ่อน การหลั่งของกระเพาะอาหารได้รับอิทธิพลจากปัจจัยทางประสาท (กลิ่น รสชาติของอาหารและการปรับสภาพ) กลไก (การยุบตัวของผนังกระเพาะอาหาร) สารเคมี (การปรากฏตัวของโอลิโกเปปไทด์) และปัจจัยของฮอร์โมน (แกสตริน)
การย่อยโปรตีนเสร็จสิ้นโดยโปรตีเอสในลำไส้ที่มีต้นกำเนิดจากตับอ่อน (เทลงในลำไส้เล็กส่วนต้น) และผลิตโดยเยื่อหุ้มของลำไส้เดียวกัน (วางบนขอบแปรง) ด้วยเหตุนี้ การย่อยโปรตีนจึงเป็นเรื่องปกติแม้หลังจากการผ่าตัดกระเพาะอาหารออก .
โปรตีเอสแบ่งออกเป็น endoprotease (ไฮโดรไลซ์พันธะเปปไทด์ภายในโปรตีน: chymotrypsin, elastase, trypsin) และ exopeptidases (ไฮโดรไลซ์กรดอะมิโนขั้วของโปรตีน: carboxypeptidase, aminopeptidase, dipeptidase)
ที่ระดับลำไส้ การย่อยโปรตีนจะเสร็จสิ้น และกรดอะมิโนเดี่ยว ไดเปปไทด์ และไตรเปปไทด์ สามารถดูดซึมและขนส่งไปยังตับโดยพาหะเฉพาะ
โปรตีนจำนวนเล็กน้อยที่มีอยู่ในอาหารจะไม่ถูกดูดซึมและถูกกำจัดออกไปด้วยอุจจาระ (5%) เปปไทด์บางชนิดที่เกิดจากกรดอะมิโนมากกว่าสามตัวจะถูกดูดซึมโดยทรานส์ไซโทซิส ดังนั้นจึงเป็นปัจจัยสำคัญสำหรับการพัฒนาของการแพ้อาหารและการแพ้อาหาร
เฉพาะในทารกแรกเกิดเท่านั้นที่สามารถดูดซับโปรตีนทั้งหมดที่ไม่ได้ย่อยได้ปรากฏการณ์นี้เป็นพื้นฐานสำหรับการดูดซึมแอนติบอดีที่ส่งผ่านน้ำนมแม่
ในการส่งกระแสประสาท ในการผลิตพลังงาน และเป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในกระบวนการเผาผลาญต่างๆ)
- การย่อยโปรตีนเป็นกระบวนการที่กดดันร่างกาย ดังนั้น การบริโภคโปรตีนที่มากเกินไปจึงส่งผลให้เกิดความเครียดที่ไม่จำเป็นและเป็นอันตรายต่อตับและไต
- การบริโภคโปรตีนในปริมาณมากกับอาหารไม่ได้ส่งเสริมการลดน้ำหนักหรือเพิ่มมวลกล้ามเนื้อ
- หากการบริโภคนี้เกิดขึ้นในบริบทที่มีแคลอรีสูง จะมีการสะสมไขมันเพิ่มขึ้นอย่างหลีกเลี่ยงไม่ได้
- หากรับประทานอาหารที่มีแคลอรีต่ำและโปรตีนสูง กรดอะมิโนแต่ละส่วนจะถูกแปลงเป็นกลูโคส ผลการลดน้ำหนักจะดี (อุณหภูมิที่เพิ่มขึ้นและความรู้สึกอิ่ม) แต่ในระยะยาวการบริโภคโปรตีนที่มากเกินไปจะก่อให้เกิดปัญหามากมายต่อร่างกาย (โรคกระดูกพรุน ภูมิคุ้มกันลดลง คีโตซีส ปัญหาทางเดินอาหาร และภาวะขาดน้ำ)
- ฮอร์โมนโปรตีน (หรือเปปไทด์) เช่น IGF-1 และฮอร์โมนการเจริญเติบโต (somatotropin หรือ GH) สามารถรับประทานได้ในรูปแบบฉีดเท่านั้น หากกลืนกินเข้าไป ร่างกายของเราจะปฏิบัติต่อพวกมันเหมือนโมเลกุลโปรตีนอื่น ๆ ทำลายพวกมันออกเป็นกรดอะมิโนแต่ละตัวหรือกำจัดพวกมันด้วยอุจจาระ (โซ่ที่ยาวกว่า 4 AA ไม่สามารถดูดซึมได้เช่นนี้และจำเป็นต้องลดขนาดลงก่อนเป็นโซ่ที่เล็กกว่า) .
- การใช้กรดอะมิโนเดี่ยวในปริมาณมากขัดขวางการขนส่งกรดอะมิโนอื่น ๆ ด้วยความอิ่มตัวของตัวพาทั่วไป ด้วยเหตุผลนี้ ค่อนข้างจะมองโลกในแง่ดีที่จะหวังว่าการได้รับกรดอะมิโนบางชนิดในปริมาณมากจะส่งผลดีต่อแอนะโบลิซึมของกล้ามเนื้อ